菌肥生产中的载体很重要，关系到菌的“活性”。

当土壤中有足够的有机质或腐殖质时，微生物可以更好地生存和繁殖并激活其他营养元素。土壤中的微生物菌主要产生各种酶，分解各种养分，产生各种酸和二氧化碳，为农作物提供更多的养分。为了微生物菌的生存和繁殖，土壤中须有足够的有机质。所以我们提倡有机肥和菌肥搭配使用。

土壤有机质含量充足，土壤理化性状良好，加强了土壤有益微生物的活动，从而促使有机质分解转化，产生多种营养物质和刺激性物质。达到增产增收的目的。缺少有机质的土壤含水性差，各类肥液对作物根系的“表达”能力较差，导致根系生长内在刺激不足。

土壤有机质的缺乏会使化肥对土壤板结的影响强度更加突出。如果有机质丰富，化肥的利用率大大提高。化肥残留在土壤中的氯离子、亚硝酸盐等物质会转化为水溶性有机化合物，以及丰富的土壤微生物的多重作用而无害化，使土地持续耕种。

因此，归根结底，“土壤板结”的负面效应不是化学肥料的结果，而是忽视对土壤使用足量有机肥。

土壤中有机质缺乏，微生物所需碳源不足，导致根系微生物群落稀疏，根系生长的外源刺激太弱，根系失去生长的外界刺激。土壤板结和药物危害(土壤中农药残留严重)，引起农作物各种病害。如果土壤富含有机质，这些危害可以减少甚至避免。

所以施用菌肥，请不要忘记补充土壤有机质。而补充土壤有机质简单直接的方法是给土壤加有机肥。